MScan jest programem przeznaczonym do analizy danych o charakterze jakościowym, działającym w oparciu o generowane przez bazodanowy system Mascot listy peptydów i białek zidentyfikowanych w próbkach. Program jest również odpowiedzialny za przygotowanie danych do analizy ilościowej białek zarówno z wykorzystaniem znakowania izotopami stabilnymi, jak i bez znakowania izopotowego.



Podstawowe funkcje programu


Format danych wejściowych


Format danych wyjściowych


Implementacja

MScan zrealizowany jest w języku programowania Java i przygotowany do działania na jedno- i wieloprocesorowych stacjach roboczych pracujących pod systemami operacyjnymi Windows, GNU/Linux oraz MacOS X.




Aktualna wersja


MScan 2.0.4 18.10.2018 Download

Programy pomocnicze

DatViewer 2.0.1 16.05.2018 (dołaczony do MScan)
mpercolator 1.0 26.12.2012 Windows (32-bit) (32-bit) Download
Windows (64-bit) (64-bit) Download
Linux (64-bit) (64-bit) Download



Poprzednie wersje


MScan 1.5.3 03.02.2014 Download



Dokumentacja


Dokumentacja użytkowa

Wymagania, instalacja, uruchomienie i konfiguracja Download


Opisy algorytmów

Algorytm wyznaczania q-wartości Download
Algorytm predykcji czasu retencji peptydów Download
Algorytm wyznaczania obwiedni izotopowej peptydów Download
Algorytm klasteryzacji białek Download


Opis programu


Pliki


Autor


Tymon Rubel

Instytut Radioelektroniki
Politechnika Warszawska