Program MScanDB jest systemem bazodanowej identyfikacji białek.
Podstawowe funkcje programu
- Identyfikacja peptydów i białek na podstawie danych z pomiarów LC-MS/MS.
- Obsługa różnorodnych baz danych sekwencji aminokwasowych (np. SwissProt, TrEMBL, NCBI).
- Możliwość wykonania przeszukania typu target/decoy.
- Estymacja procentu fałszywie pozytywnych identyfikacji peptydów i wyznaczanie q-wartości.
- Wykorzystanie wieloprocesorowości w celu przyspieszenia identyfikacji.
Format danych wejściowych
- Zbiory widm MS/MS w postaci list pików w formatach MGF lub APL.
- Bazy danych sekwencji aminokwasowych białek w formacie FASTA.
Format danych wyjściowych
Aktualna wersja
| MScanDB | 0.6 | 20.03.2021 |  Windows |
 |
 Linux |
 |
|||
 macOS |
 |