Program Diffprot umożliwia analizę statystyczną danych ilościowych z eksperymentów proteomicznych prowadzonych bez znakowania izotopowego lub ze znakowaniem metodą iTRAQ. Narzędzie jest szczególnie dobrze przystosowane do analizy danych pochodzących z niewielkiej liczby próbek i wykazuje się dużą odpornością na błędy mogące wynikać z nieprawidłowej identyfikacji peptydów.


Podstawowe funkcje programu


Format danych wejściowych


Format danych wyjściowych


Implementacja

Program napisany został w językach Perl oraz C i może być uruchomiony na na jedno- i wieloprocesorowych stacjach roboczych pracujących pod systemami operacyjnymi Windows i GNU/Linux. Funkcje wizualizacji danych wykorzystują pakiet statystyczny R.



Aktualna wersja

Diffprot 1.5.19 03.01.2013 Windows Download
Linux x86 Download



Dokumentacja


Opisy algorytmów

Opis statystyki testowej Download

Dokumentacja użytkowa

Strona podręcznika systemowego Download



Opis programu


Pliki


Autor


Michał Kistowski

Instytut Biochemii i Biofizyki
PAN