Program MSconvert dokonuje konwersji danych pomiarowych LC-MS na dwuwymiarowe mapy w formacie niezależnym od rodzaju stosowanego spektrometru. Mapy te są następnie wykorzystywane podczas analizy ilościowej zmian stężeń peptydów i białek w próbkach.
Podstawowe funkcje programu
- Konwersja bezpośrednich danych pomiarowych LC-MS pochodzących z różnych typów spektrometrów na uniwersalny format UCSF.
- Przetwarzanie wstępne widm mas w celu poprawy ich jakości. (kwantyzacja osi wartości m/z i czasu retencji, filtracja dolnoprzepustowa).
- Wykorzystanie wieloprocesorowości w celu przyspieszenia konwersji.
Format danych wejściowych
- Bezpośrednia konwersja danych pomiarowe pochodzących ze spektrometrów mas firm Thermo oraz Waters.
- Konwersja z formatu mzXML, co zapewnia kompatybilność z większością dostępnych na rynku przyrządów.
Format danych wyjściowych
- Dwuwymiarowe mapy reprezentujące widma mas próbek zapisywane są w formacie UCSF (opis formatu UCSF)
Aktualna wersja
MSconvert | 1.5.2 | 24.08.2021 | Windows (32-bit) | |
Windows (64-bit) |
Wymagania, instalacja i uruchomienie